AUTOFLEX III质谱仪配备单一基质辅助激光解吸电离（MALDI）源，能测定分子量大于400的有机小分子、多肽、蛋白质、DNA生物大分子、高分子等。具有分子离子峰信号强，碎片少，谱图简单，可测分子量高达数十万的特点。由于MALDI-MS的高通量，检测速度快，无交叉污染等特点，近些年来用此仪器来进行生物活性分子的检测也成为了热点领域。

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