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仪器1：Autoflex III型飞行时间质谱仪（MALDI-TOF-MS）
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仪器2：APEX II型傅立叶变换离子回旋共振质谱仪（FT-ICR-MS）
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主要功能及特点：配备单一基质辅助激光解吸电离（MALDI）源，能测定分子量大于400的有机小分子、多肽、蛋白质、DNA生物大分子、高分子等。具有分子离子峰信号强，碎片少，谱图简单，可测分子量高达数十万的特点。
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主要功能及特点：配备电子轰击（EI）、电喷雾电离（ESI）、离子轰击（SIMS）（类似于快原子轰击FAB）等多种离子源，高分辨高准确度地测定分子量，可推算出化合物的具体元素组成。
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仪器3：9.4T Solarix型傅立叶变换离子回旋共振质谱仪（FT-ICR-MS）
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仪器4：QP2010型气相色谱质谱联用仪（GC-MS）
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主要功能及特点：配备电喷雾电离（ESI）、基质辅助激光解吸电离（MALDI）离子源，和液相色谱，高分辨高准确度地测定分子量，可推算出化合物的具体元素组成。
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主要功能及特点：用于非极性、弱极性化合物的低分辨质谱的测定。配备电子轰击（EI）、化学电离（CI）电离源和气相色谱、直接进样装置。对混合物可进行气相色谱分离和质谱检测。
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仪器5：Ultra型气质联用质谱仪(GC-MS)
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仪器6：GCT型气相色谱质谱联用仪(GC-MS)
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主要功能及特点：用于非极性、弱极性化合物的低分辨质谱的测定。配备电子轰击（EI）、化学电离（CI）电离源和气相色谱、直接进样装置。对混合物可进行气相色谱分离和质谱检测。
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主要功能及特点：配备电子轰击（EI）、化学电离（CI）电离源和气相色谱、直接进样装置。对混合物可进行气相色谱分离和质谱检测。所得谱图具有较高的分辨率，在一定的条件下，可推算出化合物的具体元素组成。
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仪器7：Q-TOF Ultima Global型液相色谱/四极杆/飞行时间串联质谱联用仪（LC-MS）
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仪器8：LCMS-2010型液相色谱质谱联用仪（LC-MS）
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主要功能及特点：较高分辨的液相色谱-四极杆-飞行管串联质谱仪。主要用于多肽、蛋白等生物样品的分析，开展蛋白质组学等研究。配备基质辅助激光解吸电离（MALDI）、常规电喷雾电离（ESI）、纳升电喷雾（nanospray）和大气压化学电离（APCI）电离源。配备二维毛细管高效液相色谱。
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主要功能及特点：低分辨四级杆质谱仪。适合测定极性较大，在甲醇、乙腈有一定溶解度的化合物，质量检测范围小于2000。配备电喷雾电离（ESI）和大气压化学电离（APCI）电离源。
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仪器9：Orbitrap高分辨液质联用仪（LC-MS）
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主要功能及特点：具有500000的分辨率，可获得样品的精确分子质量。在有机合成、天然产物分析、高级蛋白质组学、生物制药和代谢组学等领域有广泛的应用。 该仪器具备极高的灵敏度，可以带来更出色的分析物检测、表征和定量分析能力。可以与常规液相色谱或纳升液相色谱联用，用于复杂多组分物质的分离分析。通过液相系统对多个组分进行分离后进行质谱解析，可以降低复杂组分中物质的相互干扰，便于定性定量分析；另外，对组分中的样品可挑选母离子进行 在线二级及多级质谱分析，获得更多结构信息。
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